Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TnxbO35452 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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TnxbO35452 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TnxbO35452 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms