Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms