Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Foxd2O35392 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Foxd2O35392 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Foxd2O35392 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Foxd2O35392 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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