Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcc1O35379 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcc1O35379 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcc1O35379 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcc1O35379 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcc1O35379 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Abcc1O35379 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms