Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms