Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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