Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Casq1O09165 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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