Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha8O09127 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epha8O09127 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms