Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms