Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EllO08856 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EllO08856 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EllO08856 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms