Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra2O08842 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms