Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MsmbO08540 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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