Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r88L7N1W8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms