Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2888K7N746 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms