Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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