Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms