Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21976J3QNN2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21976J3QNN2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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