Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms