Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm21972J3QN38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm21972J3QN38 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm21972J3QN38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm21972J3QN38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm21972J3QN38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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