Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms