Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21818J3KMS6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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