Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms