Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms