Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r34G3XA52 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r34G3XA52 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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