Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms