Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef1G3X9K3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms