Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nccrp1G3X9C2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms