Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim15G3UY57 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim15G3UY57 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim15G3UY57 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim15G3UY57 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim15G3UY57 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim15G3UY57 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim15G3UY57 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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