Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms