Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp9yF8VPU6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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