Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms