Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm28038F7BCN9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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