Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms