Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmgcF6VRN1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms