Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm17555F6U8B9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm17555F6U8B9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm17555F6U8B9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm17555F6U8B9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm17555F6U8B9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm17555F6U8B9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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