Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms