Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5407E9Q7Q1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5407E9Q7Q1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5407E9Q7Q1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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