Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC005561E9Q5E2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms