Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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