Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17175E9Q528 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17175E9Q528 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm17175E9Q528 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm17175E9Q528 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17175E9Q528 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms