Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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