Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms