Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
6430550D23RikE9Q1X6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms