Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irf2bp2E9Q1P8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Irf2bp2E9Q1P8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Irf2bp2E9Q1P8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Irf2bp2E9Q1P8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irf2bp2E9Q1P8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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