Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3250E9Q1M3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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