Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms