Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Ddx60E9PZQ1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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