Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gcom1E9PZ54 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms