Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms