Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5415E9PXF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms